O curso de Engenharia Ambiental utiliza os seguintes laboratórios:
- Laboratório de Química Geral;
- Laboratório de Mecânica dos Fluidos;
- Laboratório de Física;
- Laboratório de Análise e Controle Físico-químico;
- Laboratório de Geoprocessamento;
- Laboratório de Limnologia;
- Laboratório de Microbiologia;
- Laboratório de Solos;
- Laboratório de Cromatografia;
- Laboratório de Pequenas Centrais Hidroelétricas;
- Laboratório de Máquinas Térmicas;
- Laboratório de Saneamento;
- Laboratório de Informações Hídricas;
- Laboratório de Hidrogeologia;
- Laboratório de Expressão Gráfica.